يهدف التكوين المهني في قطاع الفلاحة والصيد البحري إلى تنفيذ المخططات الخاصة بالتكوين المهني ويعمل على وضع وتحيين برامج التكوين الأساسي والمستمر بما يستجيب لمتطلبات البرامج الجهوية للتنمية ولحاجيات المهنة بصفة عامة.
هذا و تعمل الوكالة على متابعة أنشطة 39 مؤسسة تكوينة راجعة لها بالنظر.